MS-06M ザク‧マリンタイプ (水中用ザク) 在進行地球侵攻作戰時,為了封鎖連邦軍在海上的補給運輸路線以及對海洋沿岸的各個基地進行強襲,
ジオン軍的技術人員MS-06F型為開發基礎,開發了水中專用的MS-06M。
初期開發的番號是MS-06M,直到後來MSM系的機體陸續開發後,才更改番號為「MSM-01」。
相對於普通的MS-06而言,頭部原先的管子由兩條變成了三條(頭頂增加了一條導氣管);
對肩部的裝甲做了減少水中阻力的調整;對各關節也做了防水處理;背部除去了原來的火箭式推進器,改成水中用的用熱核水流噴氣式推進器;兩腕也追加了水中用輔助推進器;大腿後部、小腿內側、小腿後部設置了壓艙水箱、小腿後部還設置了吸排水口。
水陸兩用型MS是一類相當特殊的MS機體。
由於必須在水中快速行動作戰,使得水陸兩用型機體的開發要求比陸戰用MS及宇宙戰用MS要高得多。
MS-06M最大的缺點就是水中用推進器和陸地上使用的不同,再加上關節防水加工上的問題,使得機體在陸上的活動受到很大的限制,因此並無法成為完全的水陸兩用機體。而且最初的設計是針對連邦軍軍用船艦和當時所生產的反潛攻擊機為主,一年戰爭中期以後,對於陸地上越來越多的MS格鬥戰和連邦軍強烈的反潛攻擊來說,
MS-06M的缺點成為日後MSM系的開發主因。
武裝方面相當簡單,主要的武器配備只有手持可發射魚雷或導彈的水中用發射器 -- サブロック・ガン,
近距離的武器只有頭部的バルカン機砲;而因機體最初設計上問題,所以沒有配載任何格鬥戰的武器。
最初的機體配屬給北大西洋潛水艦隊「シーサーペント」實驗部隊(海蛇實驗部隊),
最大的優點就是造價便宜,維修簡單,量產性高,因而成為日後ジオン軍水陸兩用型機體中,最先改良的MS。
一年戰爭後,連邦軍ティターンズ部隊接收了部分的MS-06M,將其進行了局部的改裝,
並且機體改為象徵ティターンズ的藍色,
因而成為連邦軍所屬的「マリン・ハイザック」(水中用高性能ザク),進行ジオン軍殘餘部隊的掃蕩行動。